Профессиональный путь С.Е.Нарышкина тесно связан с научно-практической и аналитической деятельностью. В разные годы работал помощником проректора по международным научным связям и заместителем начальника Отдела внешнеэкономических связей Ленинградского политехнического института; экспертом Управления научно-технического сотрудничества с зарубежными странами; третьим и вторым секретарем Посольства СССР в Бельгии; возглавлял один из отделов комитета по экономике и финансам мэрии Санкт-Петербурга, руководил отделом внешних инвестиций петербургского Промышленно-строительного банка; был заместителем председателя Комитета по экономике и инвестициям и председателем Комитета по внешнеэкономическим и международным связям Правительства Ленинградской области.
С 2004 года работает на федеральном уровне. Прошёл путь от заместителя начальника Экономического управления Администрации Президента Российской Федерации до Руководителя Администрации Президента Российской Федерации. Возглавлял ряд ключевых президентских комиссий и советов (в том числе – по противодействию коррупции).
С 2008 года по настоящее время Постоянный член Совета Безопасности Российской Федерации.
В 2011 году избирается в Государственную Думу от Ленинградской области и впоследствии, голосованием депутатов, – на пост Председателя Государственной Думы. Деятельность палаты под председательством С.Е.Нарышкина ознаменована рядом преобразований, направленных на укрепление демократии, развитие политического плюрализма, защиту конституционных основ и прав человека и гражданина, повышение открытости и прозрачности законотворческого процесса (в том числе в рамках концепции «электронного парламента»).
По инициативе С.Е.Нарышкина учреждён Совет непарламентских партий при Председателе Государственной Думы, создан ряд отраслевых экспертно-совещательных органов, дан новый импульс формату политической дискуссии в рамках «Открытой трибуны». Председатель Государственной Думы выступил одним из инициаторов создания Совета законодателей Российской Федерации и ввёл в практику подготовку ежегодных отчётов о состоянии российского законодательства, способствовал учреждению памятной даты – Дня российского парламентаризма. Активно продвигает ценности и традиции международной парламентской дипломатии.
В 2012 году С.Е.Нарышкин выступил одним из инициаторов воссоздания Российского исторического общества и стал его Председателем. Годом позже возглавил Организационный комитет по подготовке мероприятий, связанных со 100-летием Первой мировой войны, в 2015 году – Организационный Комитет по проведению в Российской Федерации Года литературы, преобразованный в Организационный комитет по поддержке литературы, книгоиздания и чтения в Российской Федерации в 2016-2018 годах.
Является членом Всероссийской политической партии «ЕДИНАЯ РОССИЯ», членом Бюро Высшего Совета Партии. Координирует партийные проекты «Историческая память», «500 бассейнов», «Крепкая семья». Большое внимание уделяет популяризации спорта, возглавляет Высший наблюдательный совет Всероссийской федерации плавания.
С.Е.Нарышкин занимается поддержкой важнейших социальных институтов: в частности, патронирует Кингисеппский детский дом, принимает личное участие в судьбе детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, содействует их устройству в приёмные семьи.
